Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms