Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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