Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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