Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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SNCBQ16143 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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SNCBQ16143 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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SNCBQ16143 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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SNCBQ16143 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SNCBQ16143 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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