Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
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NCOA1Q15788 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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NCOA1Q15788 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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NCOA1Q15788 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
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NCOA1Q15788 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
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NCOA1Q15788 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
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NCOA1Q15788 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
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NCOA1Q15788 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
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