Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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