Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
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