Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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