Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
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