Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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