Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCM1Q15154 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms