Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms