Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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