Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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