Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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