Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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COL9A2Q14055 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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COL9A2Q14055 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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COL9A2Q14055 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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COL9A2Q14055 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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COL9A2Q14055 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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COL9A2Q14055 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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COL9A2Q14055 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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COL9A2Q14055 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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