Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCINQ13939 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCINQ13939 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCINQ13939 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCINQ13939 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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