Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms