Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms