Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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