Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
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