Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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