Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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