Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAPQ12770 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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