Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms