Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms