Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms