Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGM3Q08188 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms