Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms