Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FPGSQ05932 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FPGSQ05932 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FPGSQ05932 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FPGSQ05932 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FPGSQ05932 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms