Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms