Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6Q03468 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms