Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4A11Q02928 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms