Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPCQ01831 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPCQ01831 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
XPCQ01831 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
XPCQ01831 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPCQ01831 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms