Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms