Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms