Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAE1P78406 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAE1P78406 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAE1P78406 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAE1P78406 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAE1P78406 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAE1P78406 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAE1P78406 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAE1P78406 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAE1P78406 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAE1P78406 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAE1P78406 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAE1P78406 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAE1P78406 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAE1P78406 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms