Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB1AP62820 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB1AP62820 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB1AP62820 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB1AP62820 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms