Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms