Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO4P61968 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO4P61968 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO4P61968 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO4P61968 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms