Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP11P59045 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP11P59045 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP11P59045 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP11P59045 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP11P59045 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP11P59045 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms