Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP6P59044 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP6P59044 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP6P59044 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP6P59044 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms