Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP9P55211 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP9P55211 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms