Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLTPP55058 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLTPP55058 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLTPP55058 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms