Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPAP53621 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COPAP53621 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPAP53621 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms