Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 480.9 ms