Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRE11P49959 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRE11P49959 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRE11P49959 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRE11P49959 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRE11P49959 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms