Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms