Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTPAP49638 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPAP49638 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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TTPAP49638 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPAP49638 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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TTPAP49638 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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TTPAP49638 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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