Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGAEP38570 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms